窺基：此舉頌文，依次列出六種根本煩惱。百法明門論中，癡是居於慢後，顯示癡通利鈍，遍上下故，此頌顯明癡是不善根，故位在慢上。
智周：百法論顯癡通利鈍，故安癡於鈍、利兩惑中間，此唯識頌明癡是不善根，故於貪、瞋之下，慢等之上列癡。
窺基：此辨貪等六得名煩惱之所以，即解頌中「煩惱」二字。此貪等六，是隨煩惱之根本故，雖亦得名為隨煩惱，然是根本煩惱所攝，非唯是等流性，是故得煩惱名，而不名隨煩惱。《大乘阿毘達磨雜集論》卷7說：「隨煩惱者，謂所有諸煩惱，皆是隨煩惱。有隨煩惱非煩惱，謂除煩惱，所餘染污行蘊所攝一切心所法。此復云何？謂除貪等六煩惱，所餘染污行蘊所攝忿等諸心所法。」由此即顯根本煩惱得名煩惱，亦得名隨煩惱，亦是隨他生故，忿等但名隨煩惱，不名煩惱，非根本故。
窺基：自此以下，別釋貪等六種煩惱。此即說貪。論言「有」者，是說後有，即唯是異熟三有果。言「有具」者，是說中有、煩惱、業、及器世間等，此皆三有具故。或無漏法亦是有具，今大乘義，愛佛、貪滅是染污收，此皆與見俱生，緣無漏法而起，故無漏法能資長有，亦名有具。
謂由愛力，取蘊生故。
窺基：此釋前文「生苦為業」。即是，若發業貪，若潤生愛，皆能令取蘊生，非唯潤惑令取蘊生。上二界中，由愛靜慮等故，彼諸煩惱因此增長，亦得令取蘊生。
《瑜伽師地論》卷55云：「貪由十事生，一、取蘊，二、諸見，三、未得境界，四、已得境界，五、已所受用過去境界，六、惡行，七、男女，八、親友，九、資具，十、後有及無有。」
窺基：此解釋瞋。言「於苦、苦具」者，「苦」即三苦，皆能生瞋，瞋增唯由苦受，樂受雖與苦乖離，瞋亦可依之而生。「苦具」者，一切有漏法及無漏法但能生苦者，皆是苦具，瞋亦可依此而生。
願施：無漏不順苦，如何名苦具？
智周：《瑜伽師地論》卷55云：「瞋事亦有十種，一、己身，二、所愛有情，三、非所愛有情，四、過去怨親，五、未來怨親，六、現在怨親，七、不可意境，八、嫉妬，九、宿習，十、他見。瞋亦有十，如其次第依彼而生。」
窺基：此釋前文「不安隱性惡行所依為業」。即是，瞋令身心熱惱，必起不善性業，發惡業者必不善故。《大乘阿毘達磨雜集論》卷1云：「不安隱住者，謂心懷憎恚，多住苦故。」即是說瞋，與不安隱性惡行為所依。
窺基：此解釋癡。言「於諸理、事，迷闇為性」者，意謂獨頭無明迷理，相應無明亦且迷事。
智周：上說獨頭無明迷理之言，是據瑜伽論文而說。《瑜伽師地論》卷58云：「又此無明總有二種，一、煩惱相應無明，二、獨行無明。非無愚癡而起諸惑，是故貪等餘惑相應所有無明，名煩惱相應無明。若無貪等諸煩惱纏，但於苦等諸諦境中，由不如理作意力故，鈍慧士夫，補特伽羅，諸不如實簡擇、覆障、纏裹、闇昧等心所性，名獨行無明。」文中獨行無明，即是說主獨行，又非主獨行，多是迷理起，由此之故，基師從多分說獨頭無明迷理，而不言唯迷理。
窺基：此釋前文「一切雜染所依為業」。即是，由無明故，於諦等生猶豫，起邪見撥為無，而後貪等本惑、隨惑，次第生起，造諸惡業，乃復招後生諸雜染。此中是說由見道無明起者之生起次第，然由修道無明起者，則不必起疑及邪定，而是由無明起貪等故，造人、天業，復招後生雜染。
願施：此中「邪定」，即邪決定，何故基師解為邪見？
智周：有義，邪見多是由疑惑生，故「邪定」之言是但說邪見。餘見等等，戒禁取等，設是無疑，亦能生起，是故於此不說。智周更助一解，即基師解為邪見者，是通含五見，以五見皆不正故，並得邪名，有教為證，即《瑜伽師地論》卷58云：「邪見者，一切倒見，於所知事，顛倒而轉，皆名邪見，當知此見，略有二種，一者增益，二者損減。薩迦耶見，邊執見、見取、戒禁取，此四見等，一切皆名增益邪見。謗因、謗用、謗果、壞實事等，心執增益所有諸見，一切皆名損減邪見。」亦如《大乘阿毘達磨雜集論》卷1說：「邪決定者，謂顛倒智。」此顛倒智，即是包含五見。
願施：《成唯識論音響補遺》卷6云：「一切雜染者，要而言之，不出有三，所謂煩惱、業、生也。謂由下轉解，謂由無明力故，引起疑及邪見，貪等根本煩惱，忿等隨煩惱，斯即煩惱雜染因之而起。由煩惱故，造作有漏善、不善等諸業，由業習氣，能招後生五趣善、不善果，此即業、生二種雜染依之而生。故云，一切雜染所依。」
窺基：此解釋慢，文易可知。能障不慢，其「不慢」者，如前釋善法中所說。
窺基：此釋前文「生苦為業」。即是，於勝德法及有德者，心不謙下，故受眾苦。
窺基：此慢有七、九種，是於五法上生，五法即是上品、中品、下品及我，並勝德處。七慢者，如《大乘五蘊論》卷1說：「云何為慢？所謂七慢，一、慢，二、過慢，三、慢過慢，四、我慢，五、增上慢，六、卑慢，七、邪慢。云何慢？謂於劣計己勝，或於等計己等，心高舉為性。云何過慢？謂於等計己勝，或於勝計己等，心高舉為性。云何慢過慢？謂於勝計己勝，心高舉為性。云何我慢？謂於五取蘊，隨觀為我，或為我所，心高舉為性。云何增上慢？謂於未得增上殊勝所證法中，謂我已得，心高舉為性。云何卑慢？謂於多分殊勝，計己少分下劣，心高舉為性。云何邪慢？謂實無德，計己有德，心高舉為性。」此即是於下品及中品起第一慢，於中品及上品起過慢，於上品起慢過慢，於我蘊起我慢，於未證之勝德起增上慢，即雖得少分，然於所未得謂己已得，於上品起卑慢，即雖他多分勝己，然己自謂只有少分不及，於勝德起邪慢，即雖己無德，然自謂有德。增上慢與邪慢二者何別？邪慢者是全無勝德，自謂是有，其增上慢者，則是己得勝德少，自謂得多殊勝。如是於五法處起七種慢，即於三品起四，於我起一，於德起二。九慢者，大乘中不見有文，小乘中，《阿毘達磨大毘婆沙論》第一百九十九卷及《阿毘達磨俱舍論》第十九卷說有九慢，即從七慢中慢、過慢、卑慢，各分三類。
願施：《阿毘達磨大毘婆沙論》卷199云：「此九慢類，即七慢中三慢所攝，謂慢、過慢、卑慢。」《阿毘達磨俱舍論》卷19云：「然本論說慢類有九，一、我勝慢類，二、我等慢類，三、我劣慢類，四、有勝我慢類，五、有等我慢類，六、有劣我慢類，七、無勝我慢類，八、無等我慢類，九、無劣我慢類。如是九種，從前七慢三中離出。」
智周：有問，於劣謂勝，於等謂等，此既稱境而知，應無高舉，何名為慢？答云，即如《阿毘達磨順正理論》卷47云：「如是雖實勝、劣處生，而能令心高舉染惱，名慢煩惱，於理何失？」
窺基：此慢，不論七慢、九慢，一切皆通見、修所斷。然小乘義，聖雖有慢而不現行，無修道我慢故。今大乘義，修道位中得有俱生我慢，是故慢類，聖者亦得現行。顯揚論及瑜伽論第八十八卷皆說，七慢，或是俱生，或是分別，故知九慢，得於修道位起，無有過失。
願施：《瑜伽師地論》卷88云：「復次，於三種處，唯諸聖者，隨其所樂，能如實記，非諸異生，除從他聞。謂諸行中，我、我所見，我非如實，若彼為依，有我慢轉，彼雖已斷，而此我慢，一切未斷，若無起依，我慢不斷，如故現行。當知此中二種我慢，一、於諸行執著現行，二、由失念率爾現行。此中執著現行我慢，聖者已斷，不復現行，第二我慢，由隨眠故，薩迦耶見雖復永斷，以於聖道未善修故，猶起現行。」此文即說聖者得有俱生我慢現行。
窺基：此解釋疑。此中說疑，迷於諦理，猶豫為性。瑜伽論第五十八卷中說，疑依五相差別建立，即依他世、作用、因果、諦、實。今此文中雖但言諦，然諸諦理即攝彼五法盡。此意，緣理，緣事，俱得起疑。然而疑杌為人之疑，非此疑惑。
願施：何以此中言諸諦理，即攝彼五法盡？
智周：《瑜伽師地論》卷58云：「疑者，猶、豫二分不決定心所為性。當知此疑，略由五相差別建立，謂於他世、作用、因果、諸諦、實中，心懷猶豫。」此中「實」者，滅、道諦收。「作用」是業，此即是因，及「他世」中過去，皆集諦攝，總相而言，過去為現在因故。未來及果，苦諦所攝。故《大乘阿毘達磨雜集論》卷1亦云：「於諦猶豫者，亦攝於實猶豫，如其所應，滅、道諦攝故。」
窺基：有大乘異師說，疑是以慧為體，何以故？瑜伽論第五十八卷說，猶豫簡擇為疑故，又瑜伽論第八卷說，疑以異覺為體故。覺即是慧，決斷名慧，然而簡擇猶豫，異於決斷之覺，即是異覺，故疑以慧為體。此以論文為證。
智周：《瑜伽師地論》卷8云：「疑者，謂由親近不善丈夫，聞非正法，不如理作意故，即於所知事，唯用分別，異覺為體。」
窺基：此以訓詞義解。即是，「末底」是慧異名，與般若無別體，義無差異，「毘末底」者，是於慧上加毘字助，「毘」字是種種義，故毘末底是種種慧，瑜伽論言異覺為疑，其「異」者，即是種種義。既然梵云毘末底是疑義，故知疑體即慧，豈別有體？
窺基：有說，此疑別有自體，然論說疑是猶豫簡擇者，是由與慧同時之疑，或異時疑，令慧不決，故疑非即是慧。
窺基：此是引論為證。即瑜伽論第五十五卷說六煩惱中，見是世俗有，即是慧分故，餘五實有，別有性故。故知疑體，非即是慧，若即是慧，應同五見，則瑜伽論應說此疑是世俗有。
願施：《瑜伽師地論》卷55云：「問：是諸煩惱，幾世俗有，幾實物有？答：見世俗有，是慧分故，餘實物有，別有心所性。」
窺基：此說，汝以末底是慧，毘助之故，而說慧為疑體，則汝亦應以若南是智，毘助之故，而說智為識體。其實，毘是種種義，由助智故，變名為識，故毘若南非即是智。又如職吉蹉是治療義，毘職吉蹉是疑義，豈能以毘助職吉蹉故，而說疑體即是治療？
願施：梵文毘若南，此地云識。
界由助力，義便轉變，是故此疑，非慧為體。
窺基：又且，末底等是字界，界是性義，毘字是緣，由緣助界之力，義便轉變，云何緣助界已，體尚是舊而未轉變？是故此疑，非即是慧。此師所說疑義，與顯揚論、對法論同。