阿羅漢壽命盡，死了，不就自然般入無餘涅槃？沒有錯，這是最正常的方式，但是還有其他的方式。俱解脫阿羅漢，可以從滅盡定入無餘依涅槃。慧解脫阿羅漢，禪定的功夫尚未完全修成，還未能入滅盡定，故不能由滅盡定入無餘依涅槃。然而有些慧解脫阿羅漢，急欲捨壽般入無餘涅槃，就會採取自戕的方式；或有起念，想請他人殺死自己，但是立刻知道不行，因為阿羅漢們皆知殺羅漢罪極重，不會做出害人之事。
有謂：第八識獨存，是無餘涅槃。這不正確，因為無餘依涅槃界，一切有為皆永滅盡，畢竟寂靜，第八識亦是永滅。《本事經》卷3：「云何名為無餘依涅槃界？謂諸苾芻得阿羅漢，諸漏已盡，梵行已立，所作已辦，已捨重擔，已證自義，已盡有結，已正解了，已善解脫，已得遍知。彼於今時，一切所受，無引因故，不復希望，皆永盡滅，畢竟寂靜，究竟清涼，隱沒不現，惟由清淨無戲論體。如是清淨無戲論體，不可謂有，不可謂無，不可謂彼亦有亦無，不可謂彼非有非無，惟可說為不可施設究竟涅槃，是名無餘依涅槃界。」又《瑜伽師地論》卷65：「涅槃相者，謂寂滅相、無戲論相。」又《瑜伽師地論》卷80：「問：迴向菩提聲聞，為住無餘依涅槃界中，能發趣阿耨多羅三藐三菩提耶，為住有餘依涅槃界耶？答：唯住有餘依涅槃界中可有此事，所以者何？以無餘依涅槃界中，遠離一切發起事業，一切功用皆悉止息。」此中釋迦牟尼佛及彌勒菩薩皆言，無餘依涅槃界唯是無為。
又者，《瑜伽師地論》卷13云：「第一義建立者，謂唯無餘依涅槃界中，是無心地。何以故？於此界中，阿賴耶識亦永滅故，所餘諸位，轉識滅故，名無心地，阿賴耶識未永滅盡，於第一義，非無心地。」此中言阿賴耶識者，意謂第八識。第八識是有為，是有心地，非是無為，非無心地。二乘有學聖人證得無學果，成為阿羅漢，其煩惱麤重已究竟斷盡，不復執藏阿賴耶識為自內我，由斯其第八識永失阿賴耶名，轉名異熟識。而異熟識，《成唯識論》卷3云：「異熟識體，菩薩將得菩提時捨，聲聞、獨覺入無餘依涅槃時捨。」異熟識體，二乘無學是正入無餘依涅槃時捨，此中「捨」義，是永不行名捨，如《成唯識論述記》卷3釋云：「論，異熟識體至涅槃時捨。述曰：二乘正入無餘時捨，若是菩薩，金剛心捨；不行名捨，非斷縛義。」另外須知，彌勒菩薩如同釋迦牟尼佛，亦是早已成佛，故《瑜伽師地論》實即佛經。
有師辯說：「《成唯識論》卷3云：『然阿羅漢斷此識中煩惱麁重究竟盡故，不復執藏阿賴耶識為自內我，由斯永失阿賴耶名，說之為捨，非捨一切第八識體，勿阿羅漢無識持種，爾時便入無餘涅槃。』此中説『失阿賴耶名，說之為捨，非捨一切第八識體，勿阿羅漢無識持種，爾時便入無餘涅槃』者，意謂不可説阿羅漢無識持種入無餘涅槃，故知無餘涅槃界中唯有第八識。」這麼解讀論文，豈能為師？完全錯誤，應如《成唯識論述記》卷3釋云：「論，勿阿羅漢至無餘涅槃。述曰：無第八體，即阿羅漢無識持種，於金剛心正斷此時，即便應入無餘涅槃，以有漏果盡，無識持種故；勿阿羅漢得有此事，故不得捨第八識體。此中說捨，唯約執藏，以過重故，不約能所藏以為捨也。」此文解釋説，不可説捨阿賴耶識是無第八識體，若是無第八識體，則阿羅漢無識持種，那麼於金剛心正斷阿賴耶識時，便是入無餘涅槃，然彼時非是入無餘涅槃；餘文易了。吾人必須明白，《成唯識論述記》中內容，幾乎都是玄奘法師所説，是玄奘法師在講解《成唯識論》時所作的解釋，是由窺基大師記錄整理而成《成唯識論述記》。因此不要隨便詆毀《成唯識論述記》，説它解釋得不對，畢竟最能瞭解《成唯識論》的是玄奘本人。
那麼住於滅盡定，要如何入無餘依涅槃？《瑜伽師地論》卷80云：「問：諸阿羅漢，住有餘依涅槃界中，住何等心，於無餘依般涅槃界當般涅槃？答：於一切相不復思惟，唯正思惟真無相界，漸入滅定，滅轉識等，次異熟識，捨所依止；由異熟識無有取故，諸轉識等不復得生，唯餘清淨無為離垢真法界在。於此界中般涅槃已，不復墮於天、龍、藥叉、若健達縛、若緊捺洛、若阿素洛、若人等數。以要言之，所有有情假想施設，遍於十方一切界、一切趣、一切生、一切生類、一切得身、一切勝生、一切地中，非此更復墮在彼數。何以故？由此真界離諸戲論，唯成辦者內自證故。」此文之意，阿羅漢住滅盡定中，前六轉識已滅，唯第七識與異熟識彼此相依，剎那剎那生滅相續。由於阿羅漢在入滅盡定前，先起希願，欲意在滅盡定中捨識捨身，般入無餘涅槃；故在滅盡定中，以無我執故，及希願力故，忽然第七識剎那滅已，即不復再生，相續中斷；次異熟識，以無所依第七識故，剎那滅已，亦不復生，相續中斷。此時的阿羅漢，無異熟識，無異熟識攝持色身，七轉識皆永不復生，身、心俱亡，説般入無餘依涅槃。此無餘涅槃中，無阿羅漢，無一切有情數，亦無一切有為法數，唯是清淨、無為、離垢、寂滅、無戲論真法界。
對於這段《瑜伽師地論》文，《瑜伽論記》卷21釋云：「言漸入滅定者，若慧解脫人，欲入無餘時，未必入滅定，今約俱解脫，故說先入滅定。亦可羅漢將入無餘時，要入滅定，不須出定，遂入無餘。此即住於第八識入般涅槃。言唯成辦者內自證故者，有師釋云，既言辦者自證，故知雖非六趣而有其人，然下文云不可施設此是如來、聲聞等者，此顯無差別義，非無其人。然今三藏門人釋言，對修道說為辦者內證，於真法界更無證者。」
然而世尊般入無餘涅槃，於中仍可利益眾生，大行佛事，此何道理？《瑜伽師地論》卷80釋云：「問：於無餘依涅槃界中般涅槃者，於色等法，當言獲得自在，當言不得自在？答：當言獲得自在。問：此所得自在，當言能現在前，當言不能現在前？答：一分能現在前，一分不能現在前。謂諸如來，於無餘依涅槃界中般涅槃已，能現在前，所餘不能令現在前。問：若此界中離諸戲論，由此因緣，不墮眾數，云何復能起現在前？答：由先發起正弘願故，又由修習與彼相似道勢力故。譬如正入滅盡定者，雖無是念：我於滅定當可還出，或出已住。然由先時加行力故，還從定出，依有心行而起遊行。當知此中道理亦爾。」
《瑜伽論記》卷21云：「問曰：二乘入無餘，既無身智，何故復言得自在耶？解云，雖無身智，而真法界遠離繫縛，故云自在。」
為什麼阿羅漢於無餘涅槃中，不能如同如來作諸佛事？《瑜伽師地論》卷80釋云：「問：若此界中永無有障，如諸如來離一切障，阿羅漢等亦復如是，何因緣故，阿羅漢等不同如來作諸佛事？答：彼闕所修本弘願故，又彼種類種性爾故，阿羅漢等，決定無有還起意樂而般涅槃，是故不能作諸佛事。」此中阿羅漢等，謂決定種性聲聞及緣覺。
由前文的説明可知，二乘無學般入無餘涅槃，即從此不能行利益眾生之事。怪不得世尊會斥責小乘人為焦芽敗種，而且也不許菩薩現入滅盡定，如《大般若波羅蜜多經》卷592云：「滿慈子白佛言：『世尊！我謂聲聞所得諸定勝菩薩定。所以者何？聲聞具得九次第定，菩薩於中唯得前八，菩薩不得滅受想定，故聲聞定勝諸菩薩。』爾時，世尊告滿慈子：『菩薩亦得滅受想定，謂於此定已得自在，但不現入。所以者何？如來不許諸菩薩眾現入此定，勿由現入退墮聲聞或獨覺地。又滿慈子！吾當為汝更說譬喻，諸有智者由譬喻故，於甚深義易得解了。如轉輪王，雖於邊地諸小國邑皆得自在，而不自往彼國邑中，豈轉輪王不往彼處，說於彼處不得自在？如是菩薩摩訶薩眾，雖不現入滅受想定，而於此定已得自在，由自在故亦名為得。又滿慈子！非諸菩薩常不現入滅受想定，乃至未坐妙菩提座，諸佛世尊不許現入；若時得坐妙菩提座，諸佛世尊亦許現入。何以故？滿慈子！勿諸菩薩由入此定，便墮聲聞或獨覺地，或謂諸佛與二乘等故，佛世尊不許現入。』」此中世尊不許現入滅盡定的，應該是不定種性迴小向大的菩薩，彼諸菩薩或有可能退墮重回二乘，於滅盡定中般入無餘依涅槃，是故世尊不許入滅盡定。